凡是混入細胞培養(yǎng)環(huán)境中對細胞生存有害的成分和造成細胞不純的異物都可視為污染。細胞污染可分為三大類：微生物污染、細胞間交互污染和化學污染。

微生物污染：包括真菌、細菌、支原體和病毒污染。

細胞間交互污染：指的是非同種的其他細胞污染

化學污染：指影響細胞生存的非細胞所需的化學成分。

一、微生物污染

細菌和真菌污染是較容易發(fā)現的，而病毒、支原體和其他細胞系的污染是不容易被察覺的。

1. 細菌污染時培養(yǎng)液pH值改變，溶液變渾濁。細菌的大量增殖導致細胞液中營養(yǎng)大量消耗，并產生毒素抑制細胞的生長，終導致細胞崩解死亡。在有抗生素存在的條件下易造成隱性污染。

2. 病毒污染是難發(fā)現和清除的，對于實驗人員也是一個潛在的危險因素，不過病毒具有嚴格的宿主性和自限性。

3. 支原體污染是一種比較嚴重的細胞污染，難發(fā)現難去除。該種污染在顯微鏡下看不到，不引起培養(yǎng)液渾濁和pH改變。由于支原體營養(yǎng)要求高，故不容易用傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)法檢測到。此外，支原體不能通過過濾清除，且大多數抗生素對其無效！

4. 真菌污染中多是毛霉菌、孢子霉、白念珠菌、酵母菌等污染，易通過孢子傳播。霉菌污染后多數在培養(yǎng)液中形成肉眼可見的白色或淺黃色漂浮物，短期內培養(yǎng)液不渾濁。顯微鏡下觀察可見在細胞之間有縱橫交錯穿行的絲狀、管狀及樹狀菌絲。常規(guī)的抗生素、紫外線和酒精對真菌的滅菌效果較差，難以消除。真菌污染大部分是人為帶進細胞間，或者空氣環(huán)境造成。

二、細胞系交叉污染

細胞系交叉污染難于發(fā)現，當傳代細胞出現生長速度異常時，可懷疑該種污染。預防該類型污染時，操作人員應同一時間只傳一種細胞，每種細胞液要有單獨的培養(yǎng)液，并且建立細胞庫，每三個月更換一次細胞。